Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AMER1Q5JTC6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AMER1Q5JTC6 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.4 ms