Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ACSM3Q53FZ2 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ACSM3Q53FZ2 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms