Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXZ7

TTLL9, Probable tubulin polyglutamylase TTLL9, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL9Q3SXZ7 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TTLL9Q3SXZ7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms