Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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GEN1Q17RS7 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GEN1Q17RS7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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GEN1Q17RS7 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GEN1Q17RS7 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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