Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

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Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PTPROQ16827 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
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