Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SGCBQ16585 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SGCBQ16585 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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