Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACKR1Q16570 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms