Protein–RNA interactions for Protein: Q15846

CLUL1, Clusterin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUL1Q15846 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CLUL1Q15846 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CLUL1Q15846 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms