Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CCDC85BQ15834 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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