Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SKIV2LQ15477 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms