Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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SIX1Q15475 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SIX1Q15475 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
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