Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
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SF3A1Q15459 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SF3A1Q15459 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
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