Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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PDCD1Q15116 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PDCD1Q15116 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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