Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL19A1Q14993 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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COL19A1Q14993 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL19A1Q14993 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL19A1Q14993 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
COL19A1Q14993 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
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COL19A1Q14993 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
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