Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
EIF3AQ14152 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EIF3AQ14152 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms