Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Length 1,029 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ATP1A4Q13733 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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