Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
NAE1Q13564 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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