Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
GRIK3Q13003 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
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