Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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NFIAQ12857 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
NFIAQ12857 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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