Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CGNL1Q0VF96 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CGNL1Q0VF96 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms