Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SOS1Q07889 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SOS1Q07889 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms