Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPAQ06546 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPAQ06546 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms