Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PSME1Q06323 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSME1Q06323 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms