Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CENPCQ03188 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPCQ03188 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms