Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREMQ03060 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREMQ03060 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CREMQ03060 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CREMQ03060 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CREMQ03060 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CREMQ03060 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms