Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TOP2BQ02880 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TOP2BQ02880 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms