Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PTCD2P2-201ENST00000415579 1095 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC087380.1-202ENST00000415970 1163 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ETDB-201ENST00000423661 681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ETDB-202ENST00000426364 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ETDA-202ENST00000454551 388 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC114947.2-202ENST00000569313 643 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL732372.1-203ENST00000635159 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NUSAP1-203ENST00000450592 1301 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ARV1-202ENST00000366658 1170 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FAIM-204ENST00000393035 946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 LINC01762-201ENST00000423907 454 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TPRG1-AS2-201ENST00000425454 479 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC138089.1-201ENST00000450847 967 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC090680.1-201ENST00000464696 860 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL358154.1-201ENST00000627075 444 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CACNB1Q02641 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms