Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
IRF8Q02556 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms