Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CD83Q01151 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
CD83Q01151 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CD83Q01151 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CD83Q01151 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms