Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
IRF9Q00978 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms