Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FGD1P98174 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FGD1P98174 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FGD1P98174 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms