Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
HBBP68871 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
HBBP68871 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
HBBP68871 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
HBBP68871 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
HBBP68871 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms