Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CSNK2A1P68400 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CSNK2A1P68400 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms