Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
BRPF1P55201 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRPF1P55201 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms