Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FNTBP49356 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FNTBP49356 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FNTBP49356 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FNTBP49356 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FNTBP49356 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms