Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
FNTAP49354 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms