Protein–RNA interactions for Protein: P42704

LRPPRC, Leucine-rich PPR motif-containing protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRCP42704 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRPPRCP42704 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms