Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HOXA7P31268 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms