Protein–RNA interactions for Protein: P23193

TCEA1, Transcription elongation factor A protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1P23193 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TCEA1P23193 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms