Protein–RNA interactions for Protein: P18577

RHCE, Blood group Rh(CE) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHCEP18577 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RHCEP18577 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms