Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SPI1P17947 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms