Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PRG2P13727 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRG2P13727 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
PRG2P13727 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PRG2P13727 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms