Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMP4P12644 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
BMP4P12644 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
BMP4P12644 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms