Protein–RNA interactions for Protein: P12074

COX6A1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX6A1P12074 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COX6A1P12074 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms