Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GLI3P10071 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GLI3P10071 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GLI3P10071 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GLI3P10071 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms