Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HOXB7P09629 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
HOXB7P09629 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms