Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RHOP08100 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RHOP08100 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RHOP08100 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RHOP08100 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RHOP08100 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms