Protein–RNA interactions for Protein: P01857

IGHG1, Immunoglobulin heavy constant gamma 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHG1P01857 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
IGHG1P01857 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
IGHG1P01857 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms