Protein–RNA interactions for Protein: O95045

UPP2, Uridine phosphorylase 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP2O95045 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
UPP2O95045 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
UPP2O95045 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms