Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF1O43189 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF1O43189 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF1O43189 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF1O43189 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF1O43189 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHF1O43189 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHF1O43189 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms